Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PEX2P28328 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEX2P28328 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms