Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NMBP08949 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NMBP08949 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NMBP08949 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms