Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9P02748 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9P02748 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9P02748 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9P02748 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms