Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IGHV3-33P01772 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms