Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF639Q9UID6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms