Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms