Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF4Q9BZC1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms