Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EFHD1Q9BUP0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD1Q9BUP0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms