Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDXPQ96GD0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDXPQ96GD0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms