Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC97Q96F63 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms