Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAF2Q96CS3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms