Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HGDQ93099 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HGDQ93099 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HGDQ93099 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
HGDQ93099 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HGDQ93099 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HGDQ93099 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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