Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms