Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms