Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP43Q70EL4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP43Q70EL4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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USP43Q70EL4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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USP43Q70EL4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP43Q70EL4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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