Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WDR44Q5JSH3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms