Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ANKRD39Q53RE8 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms