Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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