Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBE3CQ15386 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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