Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTTNQ14247 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms