Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf61Q13536 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms