Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUSP4Q13115 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP4Q13115 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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