Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD51Q06609 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms