Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITIH3Q06033 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITIH3Q06033 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms