Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNEQ04844 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNEQ04844 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms