Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms