Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VLDLRP98155 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms