Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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