Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA2P62736 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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