Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPTEP56180 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPTEP56180 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPTEP56180 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPTEP56180 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPTEP56180 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPTEP56180 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TPTEP56180 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TPTEP56180 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TPTEP56180 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms