Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMD1P17707 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMD1P17707 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms