Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms