Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSVO60911 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSVO60911 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms