Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PDE6DO43924 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PDE6DO43924 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PDE6DO43924 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PDE6DO43924 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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