Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GFRA2O00451 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms