Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTPS2Q9NRF8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms