Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRDM8Q9NQV8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms