Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHACTR1Q9C0D0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms