Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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