Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP58Q9BVL2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms