Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TINF2Q9BSI4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms