Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC9Q96Q05 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms