Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRRC1Q96M27 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms