Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf72Q96LT7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms