Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KRT78Q8N1N4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT78Q8N1N4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms