Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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