Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms