Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL40Q2TBA0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms