Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEC23BQ15437 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms