Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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